Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 STK25-210ENST00000426941 575 ntTSL 222.61■■□□□ 1.211e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-219ENST00000452891 575 ntTSL 422.61■■□□□ 1.211e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-214ENST00000436917 499 ntTSL 420.89■□□□□ 0.931e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-227ENST00000483603 572 ntTSL 520.89■□□□□ 0.931e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-207ENST00000420551 395 ntTSL 520.78■□□□□ 0.921e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 520.37■□□□□ 0.851e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.81e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.771e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 219.85■□□□□ 0.771e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.691e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 418.08■□□□□ 0.481e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-232ENST00000495372 561 ntTSL 217.98■□□□□ 0.471e-7■□□□□ 9.5
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ILF3Q12906 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.321e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 314.76□□□□□ -0.051e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 311.88□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 39.54□□□□□ -0.881e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 CD99-201ENST00000381177 756 ntTSL 29.35□□□□□ -0.911e-7■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 CTDSPL2-203ENST00000558791 591 ntTSL 410.57□□□□□ -0.727e-6■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 CTDSPL2-205ENST00000558968 583 ntTSL 510.31□□□□□ -0.767e-6■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.97e-6■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 CTDSPL2-208ENST00000559793 575 ntTSL 58□□□□□ -1.137e-6■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 CTDSPL2-210ENST00000560834 571 ntTSL 46.89□□□□□ -1.317e-6■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.467e-6■□□□□ 9.5
ILF3Q12906 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.546e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.436e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 MTCH1-204ENST00000460219 1572 ntTSL 221.44■■□□□ 1.026e-7■□□□□ 9.4
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ILF3Q12906 UBE2F-212ENST00000439338 873 ntTSL 520.35■□□□□ 0.856e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-217ENST00000448502 561 ntTSL 420.26■□□□□ 0.836e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-215ENST00000441728 1242 ntTSL 220.02■□□□□ 0.86e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 SYMPK-209ENST00000598155 1603 ntTSL 519.99■□□□□ 0.796e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 FERMT3-206ENST00000541326 890 ntTSL 319.81■□□□□ 0.766e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-207ENST00000417231 984 ntTSL 519.74■□□□□ 0.756e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.716e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-209ENST00000433568 574 ntTSL 419.5■□□□□ 0.716e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.646e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CNN2-209ENST00000568865 1332 ntTSL 518.9■□□□□ 0.626e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.576e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-218ENST00000454786 1292 ntTSL 517.22■□□□□ 0.356e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 FERMT3-207ENST00000544997 1006 ntTSL 316.45■□□□□ 0.226e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.196e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CNN2-212ENST00000607102 307 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.126e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-214ENST00000440223 830 ntTSL 315.62■□□□□ 0.096e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 FERMT3-209ENST00000546255 564 ntTSL 315.41■□□□□ 0.066e-7■□□□□ 9.4
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ILF3Q12906 UBE2F-216ENST00000445676 831 ntTSL 314.79□□□□□ -0.046e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CNN2-210ENST00000569352 731 ntTSL 514.72□□□□□ -0.056e-7■□□□□ 9.4
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ILF3Q12906 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.196e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CNN2-204ENST00000562075 623 ntTSL 1 (best)13.87□□□□□ -0.196e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ADGRE5-207ENST00000587535 931 ntTSL 313.67□□□□□ -0.226e-7■□□□□ 9.4
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ILF3Q12906 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.266e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.316e-7■□□□□ 9.4
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ILF3Q12906 CNN2-211ENST00000606983 537 ntTSL 311.11□□□□□ -0.636e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.646e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-213ENST00000439780 571 ntTSL 510.34□□□□□ -0.756e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ADGRE5-201ENST00000242786 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.796e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ADGRE5-209ENST00000587728 587 ntTSL 410.03□□□□□ -0.86e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-208ENST00000433241 803 ntTSL 210□□□□□ -0.816e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-210ENST00000434137 472 ntTSL 510□□□□□ -0.816e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-SCLY-201ENST00000449191 951 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.826e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ADGRE5-208ENST00000587606 572 ntTSL 29.5□□□□□ -0.896e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-211ENST00000434655 648 ntTSL 59.13□□□□□ -0.956e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 MTCH1-203ENST00000418541 602 ntTSL 38.69□□□□□ -1.026e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.36e-7■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ACSF2-218ENST00000510410 1745 ntTSL 223.43■■□□□ 1.341e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.981e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ACSF2-206ENST00000503408 554 ntTSL 420.79■□□□□ 0.921e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.881e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.71e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.551e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 GGNBP2-214ENST00000616019 695 ntTSL 217.83■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ACSF2-208ENST00000504945 544 ntTSL 217.69■□□□□ 0.421e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ACSF2-211ENST00000506582 594 ntTSL 517.69■□□□□ 0.421e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 PHRF1-204ENST00000532550 748 ntTSL 317.17■□□□□ 0.341e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.231e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 XPO6-223ENST00000574435 765 ntTSL 515.88■□□□□ 0.131e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.091e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CNOT1-217ENST00000569263 304 ntTSL 212.91□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 XPO6-222ENST00000573645 509 ntTSL 312.21□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.671e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 TRIM27-203ENST00000414543 1813 ntTSL 39.93□□□□□ -0.821e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 CLSTN1-203ENST00000435891 3829 ntTSL 29.56□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 9.4
ILF3Q12906 GSPT1-208ENST00000565267 1864 ntTSL 58.91□□□□□ -0.981e-6■□□□□ 9.4
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