Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms