Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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