Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc166S4R181 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc166S4R181 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc166S4R181 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms