Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tsc22d3Q9Z2S7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsc22d3Q9Z2S7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms