Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp5Q9Z2P8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms