Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Crlf3Q9Z2L7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crlf3Q9Z2L7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms