Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfkbiaQ9Z1E3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfkbiaQ9Z1E3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms