Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slfn1Q9Z0I7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slfn1Q9Z0I7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slfn1Q9Z0I7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Slfn1Q9Z0I7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slfn1Q9Z0I7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slfn1Q9Z0I7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slfn1Q9Z0I7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slfn1Q9Z0I7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms