Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN7Q9Y6W3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN7Q9Y6W3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms