Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC61Q9Y6R9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC61Q9Y6R9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC61Q9Y6R9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC61Q9Y6R9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms