Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
MAP3K4Q9Y6R4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
MAP3K4Q9Y6R4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
MAP3K4Q9Y6R4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
MAP3K4Q9Y6R4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC38.01■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC38■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
MAP3K4Q9Y6R4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms