Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCOA3Q9Y6Q9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCOA3Q9Y6Q9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
NCOA3Q9Y6Q9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NCOA3Q9Y6Q9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms