Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAI2Q9Y5P3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAI2Q9Y5P3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAI2Q9Y5P3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms