Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP4S1Q9Y587 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4S1Q9Y587 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4S1Q9Y587 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms