Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXND1Q9Y4D7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXND1Q9Y4D7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXND1Q9Y4D7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXND1Q9Y4D7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms