Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPB41L3Q9Y2J2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41L3Q9Y2J2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB41L3Q9Y2J2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms