Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS9D1Q9Y2B5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS9D1Q9Y2B5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS9D1Q9Y2B5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS9D1Q9Y2B5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms