Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUDCQ9Y266 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUDCQ9Y266 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NUDCQ9Y266 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NUDCQ9Y266 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NUDCQ9Y266 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms