Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp1a4Q9WV27 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp1a4Q9WV27 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1a4Q9WV27 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms