Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opn3Q9WUK7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Opn3Q9WUK7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Opn3Q9WUK7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Opn3Q9WUK7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms