Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF1

Vmn1r49, Vomeronasal type-1 receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r49Q9WUF1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r49Q9WUF1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r49Q9WUF1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vmn1r49Q9WUF1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r49Q9WUF1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms