Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SPG7Q9UQ90 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SPG7Q9UQ90 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPG7Q9UQ90 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPG7Q9UQ90 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPG7Q9UQ90 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms