Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SATB2Q9UPW6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SATB2Q9UPW6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SATB2Q9UPW6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms