Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMD4AQ9UPU9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD4AQ9UPU9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4AQ9UPU9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms