Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SORCS3Q9UPU3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SORCS3Q9UPU3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SORCS3Q9UPU3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SORCS3Q9UPU3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SORCS3Q9UPU3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms