Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL8

SHROOM4, Protein Shroom4, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM4Q9ULL8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC47.02■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC47■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47■■■■■ 5.12
SHROOM4Q9ULL8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC47■■■■■ 5.11
SHROOM4Q9ULL8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC46.99■■■■■ 5.11
SHROOM4Q9ULL8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
SHROOM4Q9ULL8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
SHROOM4Q9ULL8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC46.96■■■■■ 5.11
SHROOM4Q9ULL8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.95■■■■■ 5.11
SHROOM4Q9ULL8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
SHROOM4Q9ULL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.11
SHROOM4Q9ULL8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC46.93■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC46.93■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC46.92■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC46.91■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC46.89■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC46.89■■■■■ 5.1
SHROOM4Q9ULL8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC46.87■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC46.84■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.84■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC46.84■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC46.83■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC46.82■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
SHROOM4Q9ULL8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC46.8■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC46.78■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC46.78■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC46.78■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.08
SHROOM4Q9ULL8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC46.75■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC46.75■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC46.75■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC46.69■■■■■ 5.07
SHROOM4Q9ULL8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
SHROOM4Q9ULL8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms