Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRID1Q9ULK0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRID1Q9ULK0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRID1Q9ULK0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms