Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF346Q9UL40 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF346Q9UL40 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF346Q9UL40 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 845.2 ms