Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC9Q9UKV0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC9Q9UKV0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HDAC9Q9UKV0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HDAC9Q9UKV0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms