Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PARP4Q9UKK3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PARP4Q9UKK3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PARP4Q9UKK3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PARP4Q9UKK3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PARP4Q9UKK3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms