Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL1Q9UKG1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APPL1Q9UKG1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APPL1Q9UKG1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APPL1Q9UKG1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms