Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SCP2D1Q9UJQ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCP2D1Q9UJQ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCP2D1Q9UJQ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms