Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEFL1Q9UHV5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAPGEFL1Q9UHV5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAPGEFL1Q9UHV5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEFL1Q9UHV5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEFL1Q9UHV5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEFL1Q9UHV5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEFL1Q9UHV5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEFL1Q9UHV5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms