Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPKQ9UHJ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHPKQ9UHJ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPKQ9UHJ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms