Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SRP68Q9UHB9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SRP68Q9UHB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SRP68Q9UHB9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SRP68Q9UHB9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SRP68Q9UHB9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms