Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
IFT172Q9UG01 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
IFT172Q9UG01 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT172Q9UG01 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms