Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTI1BQ9UEU0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VTI1BQ9UEU0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1BQ9UEU0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1BQ9UEU0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms