Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC1

NFKBIL1, NF-kappa-B inhibitor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIL1Q9UBC1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFKBIL1Q9UBC1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFKBIL1Q9UBC1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIL1Q9UBC1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms