Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
MBD2Q9UBB5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD2Q9UBB5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD2Q9UBB5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms