Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN10Q9UBB4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATXN10Q9UBB4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN10Q9UBB4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms