Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Slit2Q9R1B9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Slit2Q9R1B9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Slit2Q9R1B9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Slit2Q9R1B9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms