Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hsf4Q9R0L1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hsf4Q9R0L1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hsf4Q9R0L1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hsf4Q9R0L1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 333 ms