Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AmfrQ9R049 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AmfrQ9R049 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms