Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Abt1Q9QYL7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abt1Q9QYL7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abt1Q9QYL7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Abt1Q9QYL7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms