Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnckQ9QYK9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnckQ9QYK9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PnckQ9QYK9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PnckQ9QYK9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms