Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snai3Q9QY31 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai3Q9QY31 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snai3Q9QY31 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms