Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcsk1nQ9QXV0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcsk1nQ9QXV0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.1 ms