Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lsm4Q9QXA5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lsm4Q9QXA5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lsm4Q9QXA5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms