Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rai2Q9QVY8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rai2Q9QVY8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rai2Q9QVY8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rai2Q9QVY8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms